El equipo directivo de la RAP Eje Cafetero está conformado en la actualidad por el Gerente de la entidad Luis Guillermo Agudelo Ramírez, la Subgerencia de Planeación Estratégica y Prospectiva, Humberto Tobón, Subgerencia de Proyectos y Ordenamiento Regional, Alejandro Martín Rozo Gaeth,  Subgerencia Administrativa y Financiera, Luis Ernesto Salazar Jiménez.